宋晨


 

研究员、长聘副教授、博士生导师

电话:010-62759559
邮箱:c.song_at_pku.edu.cn
实验室主页: https://cqb.pku.edu.cn/songgroup/ 


研究领域:

理论与计算生物物理;生物信息学;计算生物学;膜蛋白的预测、模拟与设计


研究兴趣:

宋晨实验室发展多尺度计算模拟与人工智能方法,进行膜蛋白和膜多肽的序列筛选、结构预测、动态模拟、功能设计,以期在生物物理机制解析、新型药物研发及合成生物学中做出贡献。


荣誉项目:

国家重大人才(教育部);国家重点研发计划项目首席科学家


教育经历:

2007年毕业于山东大学物理学院,获凝聚态物理博士学位

2002年毕业于山东大学物理学院,获物理学学士学位

工作经历:

2023年8月至今,北京大学前沿交叉学科研究院,研究员,长聘副教授

2016年4月-2023年7月,北京大学前沿交叉学科研究院,研究员,预聘助理教授

2013-2015,英国牛津大学,牛顿国际学者,玛丽居里学者

2010-2012,德国马克斯·普朗克研究所(生物物理化学所),洪堡博士后,马克斯·普朗克博士后

2007-2009,澳大利亚西澳大学,博士后


代表性文章:

1. Han, Z.; Wang, L.; Song, C.* Improved Anisotropic Network Models for Membrane Protein Dynamics and Mechanosensitive Ion Channels. PRX Life 2026, 4, 013025.

2. Wang, L.#; Kang, K.#; Song, C.* ProtRAP-LM: Efficient Protein Relative Accessibility Prediction and Proteome-Wide Membrane Protein Screening. Genom. Proteom. Bioinform. 2026, qzag013.

3. Li, J.; Guo, H.; Song, C.* MemConverter: An Iterative Pipeline for Reprogramming Protein Localization in Membrane or Aqueous Solution. J. Chem. Theory Comput. 2026, 22, 2028-2042.

4. Li, J.#; Yang, C.#; Dong, R.; Juarez, J.; Wang, L.; Wettstein, M.; Wang, D.; Cao, C.; Lu, Y.*; Song, C.* Mechanism-Driven Screening of Membrane-Targeting and Pore-Forming Antimicrobial Peptides. Adv. Sci. 2025, e16470.

5. Dong, R.; Cao, Q.; Song, C.* Painting Peptides with Antimicrobial Potency Through Deep Reinforcement Learning. Adv. Sci. 2025, e06332.

6. Xue, L.; Yan, N.; Song, C.* Deciphering Ca2+ Permeation and Valence Selectivity in CaV1: Molecular Dynamics Simulations Reveal the Three-Ion Knock-On Mechanism. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2025, 122, e2424694122.

7. Yang, S.; Song, C.* Multiple-Basin Gō-Martini for Investigating Conformational Transitions and Environmental Interactions of Proteins. J. Chem. Theory Comput. 2025, 21, 5304–5321.

8. Wang, L.; Zhang, J.; Wang, D.; Song, C.* Membrane Contact Probability: An Essential and Predictive Character for the Structural and Functional Studies of Membrane Proteins. PLoS Comput. Biol. 2022, 18, e1009972.

9. Wang, Y.#; Guo, Y.#; Li, G.; Liu, C.; Wang, L.; Zhang, A.; Yan, Z.*; Song, C.* The Push-to-Open Mechanism of the Tethered Mechanosensitive Ion Channel NOMPC. eLife 2021, 10, e58388.

10. Zhang, A.; Yu, H.; Liu, C.; Song, C.* The Ca2+ Permeation Mechanism of the Ryanodine Receptor Revealed by a Multi-Site Ion Model. Nat. Commun. 2020, 11, 922.