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研究员、长聘副教授、博士生导师 电话:010-62759559 |
担任职务:
北京大学定量生物学中心研究员
北京大学-清华大学生命科学联合中心研究员
研究方向:
理论与计算生物物理、计算生物学
研究兴趣:
宋晨研究组运用多尺度计算模拟和深度学习的方法,研究离子通道和抗菌肽等膜蛋白的微观功能机理,旨在深入理解跨膜信号传导和物质转运过程,以及膜蛋白与细胞膜的相互作用等;同时,探索相关膜蛋白的改造设计,以及靶向膜体系的药物分子的设计与优化等。
教育经历:
2007年毕业于山东大学物理学院,获凝聚态物理博士学位
2002年毕业于山东大学物理学院,获物理学学士学位
工作经历:
2023年8月至今,北京大学前沿交叉学科研究院,研究员,长聘副教授
2016年4月-2023年7月,北京大学前沿交叉学科研究院,研究员,预聘助理教授
2013-2015,英国牛津大学,牛顿国际学者,玛丽居里学者
2010-2012,德国马克斯·普朗克研究所(生物物理化学所),洪堡博士后,马克斯·普朗克博士后
2007-2009,澳大利亚西澳大学,博士后
代表性文章:
1. Xue, L.; Yan, N.; Song, C.* Deciphering Ca2+ Permeation and Valence Selectivity in CaV1: Molecular Dynamics Simulations Reveal the Three-Ion Knock-On Mechanism. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2025, 122, e2424694122.
2. Yang, S.; Song, C.* Multiple-Basin Gō-Martini for Investigating Conformational Transitions and Environmental Interactions of Proteins. J. Chem. Theory Comput. 2025, 21, 5304–5321.
3. Yang, S.; Song, C.* Switching Gō-Martini for Investigating Protein Conformational Transitions and Associated Protein–Lipid Interactions. J. Chem. Theory Comput. 2024, 20, 2618–2629.
4. Wang, L.; Zhang, J.; Wang, D.; Song, C.* Membrane Contact Probability: An Essential and Predictive Character for the Structural and Functional Studies of Membrane Proteins. PLoS Comput. Biol. 2022, 18, e1009972.
5. Wang, Y.†; Guo, Y.†; Li, G.; Liu, C.; Wang, L.; Zhang, A.; Yan, Z.*; Song, C.* The Push-to-Open Mechanism of the Tethered Mechanosensitive Ion Channel NompC. eLife 2021, 10, e58388.
6. Zhang, A.; Yu, H.; Liu, C.; Song, C.* The Ca2+ Permeation Mechanism of the Ryanodine Receptor Revealed by a Multi-Site Ion Model. Nat. Commun. 2020, 11, 922.
7. Köpfer, D. A.†; Song, C.†*; Gruene, T.; Sheldrick, G. M.; Zachariae, U.*; de Groot, B. L.* Ion Permeation in K+ Channels Occurs by Direct Coulomb Knock-On. Science 2014, 346, 352–355.